Académico con trayectoria en investigación en biología molecular de modelos animales, en particular el pez cebra. Actualmente, trabaja en genómica de organismos silvestres en el marco de un proyecto Instituto Milenio. El Prof. Allende ha publicado más de 100 artículos, ha graduado a más de 25 doctores, es miembro de la Academia Chilena de Ciencias y ha dirigido 3 centros de excelencia.